Lodro Gyatso è nato nella regione di Takchuk in Kumbum in Amdo, nel 1635, anno del ciclo undicesima sessagenario. In giovane età si è recato a Lhasa e immatricolato Università Monastica di Drepung. Lodro Gyatso cominciò la sua educazione monastica con le letture e le scritture di base, memorizzando testi di preghiera e di importanti testi filosofici. Ha poi studiato il curriculum monastico Geluk dalla sezione sutra sotto eminenti studiosi, e poi si iscrisse al college per studiare Gyume tantra, con i suoi riti e rituali, disegni mandala e argomenti correlati. Secondo le fonti, Gomang abate Lobzang Ngawang era il suo tutore capo.
